趙高弒殺秦二世胡亥後，去秦帝號，立子嬰為秦王。
關於子嬰的身份，千百年來，眾說紛紜，通常認為他是秦始皇的孫子、長子扶蘇的兒子。可是，如果子嬰是秦始皇的孫子，那麼，子嬰的兒子就是秦始皇的曾孫。秦始皇去世時，不過五十歲，而子嬰在誅殺趙高前，曾與兩個兒子密謀，可見子嬰之子的年齡已經不小，那麼，五十歲的秦始皇，可能有那麼大的曾孫嗎？
這是人們懷疑子嬰身分的重大疑點。
此外，關於子嬰的真實身份，史書記載也語焉不詳。有關秦朝史料的最主要正史《史記》中，居然記載了子嬰的四個身分。
身份一：子嬰是秦始皇的孫子。
依據：
立二世之兄子公子嬰為秦王。 （《史記秦始皇本紀》）
二世指的是秦二世胡亥，兄子是哥哥的兒子（而且是親哥的兒子，如果是堂哥之子，則是「從兄子」）的意思，胡亥是秦始皇的兒子，胡亥的哥哥的兒子，自然就是秦始皇的孫子。
身份二：秦始皇的兒子
依據：
高立二世兄子嬰。 （《六國年表》）
「兄子嬰」的意思，可以理解成“哥哥子嬰（子嬰是名）”，胡亥是秦始皇的兒子，胡亥的哥哥，自然也是秦始皇的兒子。
不過，這種可能性很低。因為胡亥即位後，為掩蓋篡改秦始皇遺詔的秘密，以及防止諸公子爭奪皇位，對自己的兄弟姊妹、秦始皇的子女大肆屠殺。
於是群臣諸公子有罪，輒下高，令鞠治之?。殺大臣蒙毅等，公子十二人僇死鹹陽市，十公主矺死於杜，財物入於縣官，相連坐者不可勝數。
公子高欲奔，恐收族……請從死，願葬酈山之足。胡亥可其書，賜錢十萬以葬。 （《李斯列傳》）
乃行誅大臣及諸公子，以罪過連逮捕少近官三郎，無得立者，而六公子戮死於杜。
公子將閏昆弟三人囚於內宮，議其罪獨後。二世使使令將閩曰：「公子不臣，罪當死，吏致法焉。」（《秦始皇本紀》）
人們通常認為，秦二世已經將秦始皇的子女斬盡殺絕，既然如此，趙高不可能立秦始皇的兒子、胡亥的哥哥為秦王。而且，「兄子嬰」本身也有不同的解釋，除了可以理解成胡亥的哥哥，也可以理解成胡亥哥哥的兒子（兄之子「嬰」）。
身份三：秦始皇的侄兒。
依據：
召始皇弟子嬰，授之璽。子嬰即位，患之，乃稱疾不聽事，與宦者韓談及其子謀殺高。 （《李斯列傳》）
「始皇弟子嬰」可以斷句為“始皇弟子，嬰”，也就是秦始皇弟弟的兒子“嬰”。秦始皇弟弟的兒子，自然就是秦始皇的姪子。
身份四：秦始皇的弟弟。
史料來源同上，只不過斷句不同——“始皇弟，子嬰”，意思是秦始皇的弟弟子嬰。
但這種可能性可以斷定為零。秦始皇的同姓兄弟，即莊襄王的兒子，莊襄王子嗣不多，史料記載上不可能出錯。莊襄王只有兩個兒子，除了秦始皇，便是長安君成蟜，而成蟜早在秦始皇即位初年，便因謀反逃離秦國，不可能繼承王位。而且，成蟜也不叫子嬰。
秦始皇除了成蟜，倒是還有兩個弟弟，但他們是嫪毐和秦始皇的母親趙姬所生，不是王室血脈，根本沒有資格繼承王位。何況他們已經被秦始皇處死。
綜上所述，子嬰的身份只有三種，其一是秦始皇的孫子，可能性較大；其二是秦始皇的侄兒，可能性也比較大；其三是秦始皇的兒子，可能性很小。
首先說秦始皇的兒子。
有人認為，子嬰不可能是秦始皇的兒子，因為秦始皇的子女已全部被胡亥誅殺。事實上，史書上並沒有明確記載胡亥已經將兄弟姊妹趕盡殺絕，那隻是後人的推斷：胡亥為防止諸公子奪位，連姊妹都殺，又豈會留下兄弟？
但這畢竟只是推斷，未必是事實。智者千慮尚且必有一失，憑什麼胡亥就不能有一「失」？胡亥也是人，雖然天性惡毒，但未必沒有一絲惻隱之心，如果某位公子與胡亥關係極佳，又表現得胸無大志無欲無求，且不與大臣交通，沒有外戚勢力，胡亥放他一馬，也不是沒有可能。
當然，這種可能性非常低。而且，如果子嬰是秦始皇的兒子，胡亥被弒後，趙高擁立他即位，也不符合宗法制度，秦朝很早採取了父死子繼的繼承製度。
再說秦始皇的侄兒。
如果子嬰是秦始皇的侄兒，那便只可能是長安君成蟜的兒子。有一種說法，成蟜叛亂逃離秦國後，他的兒子並沒有離開秦國，胡亥死後被趙高擁立為王。如果子嬰是秦始皇的侄兒，那麼，密謀誅殺趙高時，與兩個兒子商議的事，便完全符合情理。
不過，如果子嬰是成蟜的兒子，成蟜叛亂出逃後，以秦始皇果敢狠辣的手段，會放過這個孩子嗎？要知道，秦始皇連自己親弟弟都可以毫不猶豫地處死。個人覺得，秦始皇或許不會殺成蟜之子，但廢黜其宗室身分的可能性很高。若是如此，成蟜之子便不可能以宗室身分即位。
此外，這種說法只是人們的猜測，史書上並沒有記載。所以，子嬰是秦始皇侄兒的說法，可能性也不是很大。
最後說秦始皇的孫子。
很多人認為，子嬰是秦始皇孫子的可能性極低，理由前面已經提到，但個人不敢苟同。恰恰相反，在以上四種身分中，我認為子嬰是秦始皇孫子的可能性最大。
首先，子嬰是秦始皇孫子之說，記載於《秦始皇本紀》。
雖然司馬遷在別處記載了子嬰的不同身份，但偏偏把這一說法記載於《秦始皇本紀》，這顯然是有用意的。那就是司馬遷也不是十分清楚子嬰的身份，但認為子嬰是秦始皇孫子的可能性最大，所以記載於《秦始皇本紀》中。
其次，如果子嬰是秦始皇的孫子，在誅殺趙高時，他的兒子能夠參與密謀的可能性是完全存在的。
秦始皇出生於秦昭襄王四十八年（前259年）正月，逝世於西元前210年，虛歲五十歲。到子嬰密謀誅殺趙高時（前207年），秦始皇已經53歲。古人都比較早熟，也比較早育，53歲的秦始皇，完全可能擁有能夠「參與大事」的曾孫。
我們假設秦始皇、扶蘇和子嬰都是十三歲生兒子，那麼，到密謀誅殺趙高時，子嬰的兒子已經十四歲。在今天，這或許還是個小屁孩，但在秦朝，已經可以參與朝廷大事。君不見，秦國的甘羅，年僅十二歲，便出使趙國，憑奇謀奪取城池十多座，官拜上卿？君不見，漢和帝劉肇清盤外戚竇憲時，也不過年滿十三歲？
既然十二歲的甘羅可以出使趙國，十三歲的漢和帝可以清算竇憲，憑什麼十四歲的子嬰之子，就不可能參與謀劃贛殺趙高？
至於秦始皇、扶蘇、子嬰十三歲有無可能十三歲生兒子，這種可能性也是比較大的，君不見，康熙帝第一個兒子承瑞出生時，他只有十三歲？既然康熙帝可以十三歲生兒子，憑什麼秦始皇不能？這種可能性還是存在的。
所以，綜上所述，如果子嬰的真實身分在上述四種身分之中，那麼，我認為子嬰是秦始皇孫子的可能性最大。至於他是不是扶甦的兒子，另當別論。